武 汉 大 学
2001年攻读硕士学位研究生入学考试试题
科目名称:分子生物学 科目代码: 477
一、解释概念(20分,每个4分)
1卫星DNA
2复制体(复制体是指参与DNA复制的蛋白质复合物，其中至少含有DNA聚合酶及引发体(primosome,引发酶与其他分子的复合物),SSB,解旋体等，复制体位于每个复制叉处进行细菌染色体DNA复制的聚合反应)
3逆转座子(在基因组内存在着通过DNA转录为RNA后，再经逆转录成为cDNA并插入到基因组的新位点上的因子，被称为逆转座子)
4反式激活因子
5衰减子与衰减作用
二、填空(30分,每空1分,请将答案写在答卷上)
1. 从病毒到高等生物的研究表明,遗传物质是 。
2. 冈崎片段的发现证实了双链DNA的 复制,在复制过程中,一条新生链的合成
是 的,称为 链;而另一条链的合成是 的,称为 链。
3. 大肠菌中有三种DNA聚合酶,其中的pol I的作用是 ,而pol III的作用是 。pol I和pol III都有的三种活性是 。
4. 由于真核细胞染色体DNA的复制要有一段RNA为引物,因此线状的DNA复制后必须存在着5’端缩短的问题。已发现有一种端粒蛋白称为 ,它由 构成,可以使单链DNA的5’延长。
5. 对DNA损伤有几种修复系统,其中只有 修复系统可以造成DNA变异,与这一系统有关的一套基因平时受到一称为 的抑制蛋白所抑制,它发挥抑制作用是结合在一段约20bp长的称为 的DNA序列上,当DNA损伤时,另一种蛋白质称为 把这种抑制蛋白水解后,修复系统的基因才会被激活。
6. 真核细胞中有三种依赖于DNA的RNA聚合酶分别合成不同的RNA,RNA pol I负责合成 ,RNA pol II负责合成 ,RNA pol III负责合成 。
7. 大分子互相作用是分子生物学的重要内容,包括蛋白质之间、蛋白质与DNA或RNA之间的互相作用,蛋白质有四种重要的结构花式与大分子互相作用有关,这些结构花式是 , , , 。
8. NO是气体小分子信号,它可由 脱氨产生,它的作用方式是直接与 酶作用使产生cGMP(环式GMP)。
9. 真核mRNA的5’ 端通常有帽子结构,3’ 端有polyA。在polyA上游有一保守序列称为polyA信号,其序列为 。polyA能提高mRNA的翻译水平是由于:
(1) (2) 。
10. G-蛋白关联受体是一类重要的细胞表面受体,它的结构特色是 ,它发挥信号传递作用的两条途径是 途径和 途径。
三、问答题(50分)
1. 说出双链DNA复制起始有关的五种重要的酶或蛋白并简述它们的功能。(15分)
2. 简述增强子的特点和性质及作用机制。(10分)
3. 简述真核RNA聚合酶II的转录起始复合物装配过程和转录起始(15分)
4. DNA限制性内切酶EcoRI是人们熟悉的常用内切酶,它是在大肠杆菌(E.coli)R株中发现的,它被广泛用于分子克隆操作和DNA分析。pUC质粒是常用克隆载体之一,它的多克隆位点上有EcoRI、BamHI、KpnI、HindIII等酶切点。假如要你把一段由EcoRI切割产生的外源DN**段克隆到pUC质粒中,并把重组质粒转化大肠杆菌R株来扩增,已知条件是所用的R菌株中只有EcoRI一种限制性内切酶,你设计如何做才能确保成功?为什么?(10分)
武 汉 大 学
2002年攻读硕士学位研究生入学考试试题
科目名称:分子生物学 科目代码: 935
一、 填空 每空1分,共40分)
1.测定蛋白分子量的主要方法是 。而要较准确测定DNA分子量的方法是根据DNA分子量的大小而采取不同的方法,分子量<5×106时用 ,分子量=5-100×106时用 ,分子量大于100×106时用 。
2.长度为20um的DNA分子,其长与宽的比是 ,该DNA分子含有 碱基对。
3.细菌中,体内DNA重组需要RecA、RecB参加,RecA起 作用,RecB起 作用。
4.许多蛋白质能解开DNA双螺旋,32-prote重要性质 和 ,所以能使DNA变性。
5.Meselson-Stahl实验中用的E.coli长时间在15N中培养后转入14N中。转入14N培养基中之后,1/2,1,世代时。总DNA中15N15N,15N14N, 14N14N的比例如下:(本题共两分)
世代 15N15N 15N14N 14N14N
1/2
1
6.原核生物转录水平的调控方式主要有① ② ③ 和④
7.一个plasmid载体含有一个大肠杆菌Lac操纵子的promotor-operator和外源基因,则这个基因的表达可以这样来控制,向培养基加入 则转录开始,要使转录停止,可以加入 。
8.紫外线诱导的胸腺嘧啶二聚体的修复可以通过四种途径进行,它们是 、 、 、和 。
其中 和 是对模板进行修复,而 修复引起突变。
9.在基因表达调控中,常常涉及顺式调控因子和反式调控因子,顺式调控因子是指 ,反式调控因子是指 。
10. 蛋白负责特定基因的开关。在数百种来源于原核和真核的DNA-结合蛋白中发现以下几种结构花式(motif)。它们是 , , 和 。它们通常以 和 ,深入到DNA双螺旋的大沟中与DNA相互作用。
11.逆转病毒即使本身并没有病毒癌基因,也可以致癌,当病毒cDNA整合于 时病毒cDNA中 能激活细胞的原癌基因的表达。
12.P53一种重要的抑癌蛋白,它的两个主要功能是(1) (2) 。P53的两个等位基因中只要其中一个变异就可能使癌发生,这是因为P53蛋白是 的形式存在和行使功能的。
13.细胞快速适应高浓度胞外信号的途径是 。
二、选择:(每题2分,共20分)
1. 关于遗传密码的论述,哪些是正确的
A、 在通用密码中,AUG是唯一的兼职密码生
B、 生物体可通过选择使用不同的同义密码来调节翻译的速度,从而进行翻译水平上的调控。
C、 无论病毒、细菌、动物、植物、细胞器,都共用一套遗传密码。
D、 在体外无细胞合成系统中合成多肽,起始密码子不存在时也能合成多肽。
2. 关于遗传密码的论述,哪些是正确的
A、 在通用密码中,AUG是唯一的兼职密码生
B、 生物体可通过选择使用不同的同义密码来调节翻译的速度,从而进行翻译水平上的调控。
C、 无论病毒、细菌、动物、植物、细胞器,都共用一套遗传密码。
D、 在体外无细胞合成系统中合成多肽,起始密码子不存在时也能合成多肽。
3. DNA polymerasel的哪个活性是使DNA复制保持忠实性的关链因素
A、 聚合活性
B、 5’-3’外切活性
C、 3’-5’ 外切活性
D、 逆转录酶活性
4. 一个λphage感染它的溶源菌时,下列情况将发生
A、 进入正常的噬菌体循环产生50个左右的噬菌体粒子
B、 λ-DNA可以环化但不复制
C、 细菌细胞将被杀死
D、 原噬菌体将被割离
E、 λ-DNA将不能注入
5. 下面的部分二倍体中,哪些表型是组成型地合成β-半乳糖苷酶
A I+o+z+y+ B i+o+z+y- C i+ocz+y+ D i+ocz-y+ E i-ocz-y+
I+o+z+y+ I-o+z+y+ I+ocz+y+ I+o+z+y+ i-o+z+y+
6. 关于真核基因表达调控特点的论述哪些是正确的
A、 真核基因组基因数目多、大多数含内含子、且与组蛋白及非组蛋白结合形成核小体及其超螺旋等结构影响基因活性
B、 转录在核内、翻译在细胞质中进行,绝大多数mRNA的形成要通过RNA是否被运输来控制基因表达
C、 真核mRNA寿命长,为翻译水平的调控提供了较大的余地
D、 真核基因表达调控可在DNA水平的调控(拷贝数、重排)、转录水平、转录后水平(RNA加工和运输)和翻译水平等多层次调控
E、 原核基因表达调控活动范围比真核更大
7. 人们为研究某一目的基因的结构,打算用基因工程的办法得此基因,请你在正面载体中选一最合适的载体
A、 表达载体
B、 分泌性载体
C、 克隆载体
D、 转移载体
E、 穿梭载体
8. 当培养基中不存在糖时,正面哪一种是gal operon上结合的蛋白质情况
A、 结合有CAP-cAMP和RNA聚合酶两种蛋白质
B、 不结合蛋白质
C、 结合有阻遇蛋白和CAP-cAMP蛋白
9. 正面关于真核生物启动子的叙述,哪些是正确的?
A、 真核生物有三种RNA聚合酶,它们利用同一种启动子
B、 DNA polymerase II利用的启动子只有一种类型
C、 RNA polymerase I利用的启动子分两部分:40~-+5和-165~-40
10. 人们打算克隆并鉴定一个分子量为36-45kb的真核单拷贝基因,首先必须使用下边哪套系统,然后再进行鉴定。
A、 用cosmid为载体建立基因文库
B、 用pBR322为载体建立基因文库
C、 用M13为载体建立基因文库
D、 用λCharon4A为载体建立基因文库
11. 与细菌中发现的转录调控相比,真核细胞中的转录调控有以下区别,其中哪一项是错误的?
A、 真核RNA polymerase单独不能起作用
B、 真核基因在转录前,需多种转录因子(general transcription factors)先在启动了上装配成复合物
C、 起始复合物装配过程包括许多步骤,每个步骤都受到调控信号或调控因子的影响
D、 在真核中大多数基因调控蛋白不能在离开它们所影响的基因相当远的地方起作用
三、问答:
1、简述(或绘图说明)真核细胞RNA聚合酶II转录的起始需要哪些基本转录因子及其装配过程(15分)
2、简述(或绘图说明)色氨酸操纵子弱化的机制(15分)
3、在讨论基因家庭时经常提到胚胎、胎儿和成体形成的蛋白质,这些述语是指什么现象?可用什么术语来描述这一类基因家族(5分)
4、 你正在进行Southern blot分析,并刚刚完成凝胶电泳部分,下一步是将胶浸泡在NaOH溶液中使DNA变性为单链,为了节约时间,你跳过这一步,直接把DNA从胶上转到硝酸纤维素膜上,你将标记好的探针与膜杂交,却发现放射自显影结果是一片空白,哪里错了呢?(5分)
武 汉 大 学
2003年攻读硕士学位研究生入学考试试题
科目名称:分子生物学 科目代码: 717
注意:所有的答题内容必须答在答题纸上,凡答在试题上的一律无效
一、下列名词翻译成中文,并简要解释(共10小题,每题4分,共40分)
1. Domains and motifs (结构域？结构域是生物大分子中具有特异结构和独立功能的区域，特别指蛋白质中这样的区域)
2. Alternative splicing （选择性剪接）
3. Reporter genes（）
4. The PCR cycle
5. Restriction mapping （限制性酶切作图）
6. Multiple cloning sites（多克隆位点 是包含多个（最多20个）限制性酶切位点（restriction site）的一段很短的DNA序列）
7. DNA libraries
8. Proteomics （蛋白质组，蛋白组学）
9. Replicon（复制子）
10. Semi-conservative replication（半保留复制）
二、简答题 (共5题,每题8分,共40分)
1,请列举三种以上蛋白质纯化技术,并说明不同纯化技术的简单原理。
2,简述DNA损伤与DNA突变之间的区别与相互关系。
3,简述密码的简并性(degeneracy)和同义密码子(synonymous codon)及其在生物学上的重要性。
密码子简并性具有重要的生物学意义，它可以减少有害突变。若每种氨基酸只有一个密码子，61个密码子中只有20个是有意义的，各对应于一种氨基酸。剩下41个密码子都无氨基酸所对应，将导致肽链合成终止。由基因突变而引起肽链合成终止的概率也会大大增加。简并性使得那些即使密码子中碱基被改变，仍然能编码出原氨基酸。密码的简并也使DNA分子上碱基组成有较大余地的变动，例如细菌DNA中G+C含量变动很大，但不同G+C含量的细菌却可以编码出相同的多肽链。所以遗传密码的简并性在物种的稳定上起着重要的作用
4,简述原核生物转录起始与转录终止过程中所涉及的主要蛋白质和核酸结构及其具体作用。
5,简述cDNA文库的构建过程。
三、论述题 (共5题,1-4题每题15分,第5题10分,共70分)
1. 人类基因组计划完成的社会意义和科学意义是什么?
HGP的研究内容
HGP的主要任务是人类的DNA测序，包括下图所示的四张谱图,遗传，基因，序列，物理图谱
HGP对人类的重要意义
1、HGP对人类疾病基因研究的贡献
2、HGP对医学的贡献
3、HGP对生物技术的贡献
4、HGP对制药工业的贡献
5、HGP对社会经济的重要影响
6、HGP对生物进化研究的影响
2. 什么是操纵子(operon)?试说明色氨酸操纵子(Trp operon)在原核基因表达调控中的调控机制和重要作用。
3. 请简要解释顺式作用元件与反式作用因子,并举二例加以说明它们的相互作用方式。
4. 试说明真核细胞与原核细胞在基因转录、翻译及DNA的空间结构方面存在的主要差异,表现在哪些方面?
5. 限制性核酸内切酶有哪几种类型?哪一种类型的限制酶最适合于基因工程,为什么?请简要说明其理由。
根据限制酶的结构,辅因子的需求切位与作用方式，可将限制酶分为三种类型，分别是第一型（Type I）、第二型（Type II）及第三型（Type III）。
第一型限制酶
同时具有修饰(modification)及认知切割(restriction)的作用；另有认知(recognize)DNA上特定碱基序列的能力，通常其切割位(cleavage site)距离认知位(recognition site)可达数千个碱基之远。例如：EcoB、EcoK。
第二型限制酶
只具有认知切割的作用，修饰作用由其他酵素进行。所认知的位置多为短的回文序列(palindrome sequence)；所剪切的碱基序列通常即为所认知的序列。是遗传工程上，实用性较高的限制酶种类。例如：EcoRI、HindIII。
第三型限制酶
与第一型限制酶类似，同时具有修饰及认知切割的作用。可认知短的不对称序列，切割位与认知序列约距24-26个碱基对。例如：EcoPI、HinfIII。
武 汉 大 学
2004年武汉大学硕士研究生入学考试分子生物学试卷
科目名称:分子生物学 科目代码:
注意:所有的答题内容必须答在答题纸上,凡答在试题上的一律无效
一,名词翻译与解释
1,synonymous codons （同义密码子）
2,RNA editing
3,Spliceosome(剪接体)
4,Microarray (基因芯片)
5, Plaque hybridization （噬菌斑杂交 把基因组中含有特定碱基序列的噬菌体，通过与RNA或DNA杂交，再从多数噬菌体的噬菌斑中选出的方法。将在琼脂培养基上形成的噬菌体的噬菌斑，拓印移于硝酸纤维素滤纸上，再用碱处理将噬菌体粒子破坏使DNA变性，然后使之固定于硝酸纤维素滤纸上，再与用放射性同位素标记的特定的RNA或DNA片段进行杂交，通过放射自显影法来识别含有所需DNA序列的噬菌体的噬菌斑，然后根据其在硝酸纤维素滤纸上的位置从原来的琼脂培养基对应位置处中选出与其对应的噬菌斑。）
6, Open reading frame（开放阅读框是基因序列中的一段无终止序列打断的碱基序列，可编码相应的蛋白）7,Ribozyme（核酶（ribozyme）是具有催化功能的RNA分子，是生物催化剂，可降解特异的mRNA序列。核酶又称核酸类酶、酶RNA、 核酶类酶RNA。 它的发现打破了酶是蛋白质的传统观念。有一些被DNA分子同样具有催化功能。）
8,RFLP （限制性内切酶片段长度多态性 RFLP标记是发展最早的DNA标记技术。RFLP是指基因型之间限制性片段长度的差异，这种差异是由限制性酶切位点上碱基的插入、缺失、重排或点突变所引起的。）
9,Site specific recombination(位点特异性重组 位点特异性重组是遗传重组的一类。这类重组依赖于小范围同源序列的联会，重组也只发生在同源的短序列的范围之内，需要位点特异性的蛋白质分子参与催化，重组的蛋白不是rec 系统而是int 等，如噬菌体l 的定点插入。重组时发生精确的切割、连接反应，DNA不失去、不合成。两个DNA分子并不进行对等的交换，有时是一个DNA分子整合到另一个DNA分子上，因此将这种形式的重组又称为插入重组)《重组类型 同源重组、位点特异性重组、异常重组》
10,RNA interference(RNA干扰)
二,简答题(共5小题,每小题10分,共50分)
1,简述真核生物 rRNA基因,tRNA 基因和mRNA基因的转录机制。
2,原核生物和真核生物中存在哪些类型的转座子?其转座机制有那些?
3,简述真核生物 DNA复制中,端粒复制与染色体其他部分DNA复制的异同和生物学意义。
端粒DNA的一条链是重复的TTTTGGGG结构，称TG链；另一条是AAAACCCC结构，称AC链。这样的重复结构少量丢失，不会伤及基因结构。但若缩短到一定程度，细胞会停止分裂
好在，分裂旺盛的细胞存在端粒酶，这种酶由蛋白质和RNA组成。其蛋白质部分能以自身RNA为模板催化合成DNA链。其RNA有一部分可与端粒TG 链突出的3'-末端互补结合，之后端粒酶以自身RNA为模版，在TG链末端添加脱氧核苷酸，使端粒TG链延长一段，随后，端粒酶移动位置，继续加长TG链，直达细胞所需长度。被延长的TG链可以作为合成冈崎片段的模板，使端粒形成双链。也可以通过回折，合成AC链，随后对末端的发夹结构进行修剪，使端粒形成双链。
4,原核生物的蛋白质合成可分为哪些阶段?简述各阶段的主要事件。
5,列举4种可用来检测,鉴定转基因动,植物的分子生物学技术和方法,简述选择这些技术的理由。
(一)是检测是否含有外源蛋白，即外源基因表达产物，主要采用酶联免疫吸附法和试纸条法；
试纸条法什么地方有卖啊？
(二)是检测是否含有外源基因(DNA)，主要有Southern杂交技术、基因芯片法和PCR检测法。
三,论述题
1,试述环境因素对DNA的损伤以及生物体中存在的DNA损伤修复系统。如果DNA损伤没有被修复会造成什么后果?
2,试比较真核生物RNA聚合酶Ⅱ识别的启动子与原核生物RNA聚合酶所识别的启动子的结构特点,各结构单元的功能是什么?为什么原核生物一种RNA聚合酶能识别不同的结构基因?
3,在进行基因工程时,载体是携带靶DN**段进入宿主细胞进行扩增和表达的工具,请问一个载体应具有哪些基本特性和结构特点?
4,人类基因组计划基本完成表明:人类基因组约有3乘10的9次方bp(而大肠杆菌的基因组约为4。6乘10的6次方bp),其中仅有百分之一的基因组DNA直接编码蛋白质,约有百分之二十四的基因组DNA为内含子,而百分七十五的基因组DNA为其他非编码序列。试从(1)传代中遗传信息的保持;(2)基因表达调空的角度来论述人类基因组如此排列的可能生物学意义。
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2005年武汉大学硕士研究生入学考试分子生物学试卷
科目名称:分子生物学 科目代码:
注意:所有的答题内容必须答在答题纸上,凡答在试题上的一律无效
一、名解(4/10)
1 Ubiquitin(泛素)
2 ribosomal binding site (RBS是Ribosomal Binding Site 核糖体结合位点 核糖体结合位点是mRNA上的特异性序列，核糖体可以识别并结合这一序列来启动翻译过程。在原核生物中该序列称为SD序列，在真核生物中则称为Kozak序列。
3 siRNA miRNA小RNA分子
4 proteome (蛋白质组)
5 DNA foot printing (dna足迹法 检测DNA序列中DNA结合蛋白识别部位的一种方法 原理：DNA被蛋白质结合后，由于蛋白质的构象保护，DNaseI不能降解这一结合位点，如果对该DNA进行一端的末端标记，并控制好DNaseI的酶量和作用时间，可将该DNA切割成大小不等的DNA片断而蛋白质保护区域不被酶解，这段区域到标记末端的片断是缺失的，对其电泳，可找出蛋白质结合位点的精确位置。)
6 single nucleotide polymorphism（snp）
7 chromosome walking（染色体步移 从第一个重组克隆插入片段的一端分离出一个片段作为探针从文库中筛选第二个重组克隆，该克隆插入片段含有与探针重叠顺序和染色体的其他顺序。从第二个重组克隆的插入片段再分离出末端小片段筛选第三个重组克隆，如此重复，得到一个相邻的片段，等于在染色体上移了一步，故称之为染色体步移（Chromosome Walking）染色体步移技术（genome walking）是一种重要的分子生物学研究技术，使用这种技术可以有效获取与已知序列相邻的未知序列。）
8 haplotype (单倍型，单倍体基因型 在遗传学上是指在同一染色体上进行共同遗传的多个基因座上等位基因的组合；通俗的说法就是若干个决定同一性状的紧密连锁的基因构成的基因型。按照某一指定基因座上基因重组发生的数量，单倍型甚至可以指至少两个基因座或整个染色体。)
9 zoo blot （动物园杂交 是基于人类及其他动物在长期进化中普遍存在的基因同源性和保守序列的理论，以同一种基因单拷贝的分子探针与各种动物的基因组DNA进行Southern杂交筛选，分离在进化过程中的保守序列，进而分离基因组中表达序列的方法。
如果某一物种的DNA序列与来自另一亲缘种的DNA片段杂交产生阳性信号，该区段可能含有一个或多个基因。）
10 transcription unit（转录单位）
二、简答(5/10)
1简述真核细胞rRNA tRNA 和mRNA转录使用的聚合酶及各 RNA前体(precursor)加工的基本过程?
2 研究表明蛋白质组比基因组更复杂,蛋白质组中存在的蛋白质数目比基因组中存在的基因数目要
多许多,这是如何造成的,你如何解释这种现象?
3 简述原核与真核细胞染色体结构的差别
4 在分子生物学研究中经常用各种载体进行研究工作,试问有哪些不同大小类型的载体,各自的主要特点是什么?
5 简述DNA损伤修复的机制,在什么情况下DNA损伤会引起DNA突变?
三、论述4/15
1蛋白质与核酸的相互作用存在于基因表达的各个水平上,请分别举例说明在基因复制RNA转录和蛋白质翻译过程中二者的相互作用。
2 一个真核细胞的蛋白质编码基因有哪些结构元件(或组建)组成(包括各种调控元件)?请画图表示,并说名各元件的功能与作用?
3 请设计一组试验来(1)克隆一个你所感兴趣的人类基因(2)并对基因产物大量表达与纯化(3)然后研究该基因的生物学功能
4 生命科学的研究已进入后基因组时代,试从“分子生物学”的角度来谈谈你对后基因组时代的认识,并预测后基因组时代里“分子生物学”发展的未来
说到后基因组时代，必须先明白后基因组学这个概念。后基因组学(postgenomics)，又称为功能基因组学(functionalgenomics)，它利用结构基因组所提供的信息和产物，发展和利用新的实验手段，通过在基因组和系统水平上全面分析基因的功能，使得生物学研究从对单一基因或蛋白质的研究转向多个基因或蛋白质同时进行系统的研究。这是在基因组静态碱基序列弄清楚之后转入对基因组动态的生物学功能研究。研究内容包括基因组发现、基因表达分析及突变检测。
而后基因组时代指的就是生物界，特别是从事分子生物学的科学工作者，将研究方向向功能基因组方向转移的时代趋势
武 汉 大 学
2006年武汉大学硕士研究生入学考试分子生物学试卷
科目名称:分子生物学 科目代码:
注意:所有的答题内容必须答在答题纸上,凡答在试题上的一律无效
一、名解4*10
1、DNA Microarray（基因芯片）
2、Spliceosome（剪接体）
3、Cosmid vector（黏粒载体）
4、Proteasome（蛋白酶体 蛋白酶体(proteasomes) 是在真核生物和古菌中普遍存在的，在一些原核生物中也存在的一种巨型蛋白质复合物。在真核生物中，蛋白酶体位于细胞核和细胞质中。主要作用是降解细胞不需要的或受到损伤的蛋白质。）
5、Zinc finger domain
6、DNase I hypersensitivity（DNA酶超敏性）
7、Insulator （绝缘子 绝缘子（英语：insulator）是真核生物基因组的调控元件之一，亦为一种边界元件。功能为阻止临近调控元件，对它所界定基因的启动子起增强或者阻遏的作用。[3] 它对增强子的抑制作用具有极性，即只对处于其所在边界另一侧的增强子有抑制作用，而并不能抑制与其处于同一结构域的增强子）
8、Post-transcriptional gene silencing（转录后基因沉默 研究结果发现有大量的转基因植株不能正常表达，通常这并不是由于转基因的缺失或突变引起的，而是基因失活的结果.这种失活的现象称为基因沉默。部分的植物中的基因沉默是在转录后发生的，称为转录后基因沉默。）
9、Reverse transcription PCR (反转录PCR)
10、Missense mutation （错义突变）
二、简答题 10*5
1、简述microRNA 的基因调控功能与机制。
2、简述染色体端粒复制的问题,人正常细胞和癌细胞的端粒复制有何不同?
3、真核生物基因组中含有几种类型的DNA序列?你如何设计实验来证明?(沉淀，有几个峰)
4、简述RNA编辑(RNA editing)的机制及其对基因表达的影响。
5、下面的DNA序列中含有一个假象基因,编码仅5个氨基酸。请写出这些氨基酸的密码子以及终止密码子,并指出RNA转录的模版是哪条链?启动子在该序列左侧还是右侧?
5-TCATGCTAGACACGTAATAGCATATGGGA-3
3-AGTACGATCTGTGCATTATCGTATACCCT-5
三、论述题15*4
1、论述一个真核基因产生有功能的蛋白质需要经过哪些分子生物学工程(event)?列出每个过程发生的细胞位置和参与的主要酶和蛋白因子。
2、有哪几种类型的遗传重组?其重组的特点如何?（三种）
3、DNA的甲基化在遗传信息的传递、DNA复制和DNA损伤修复等过程中有什么重要意义?请举例说明。
4、假如你进入实验室开始研究一个小鼠DNA结合蛋白的生物学功能:
(1)、请设计实验确定其编码基因在小鼠细胞内的表达水平?
(2)、请设计实验确定该蛋白的那个结构域具有DNA结合功能?
(3)、如何确定该蛋白在小鼠体内(in vivo)的生物学功能。
2007年攻读硕士学位研究生入学考试试题
科目:分子生物学 科目代码:475
一、名词翻译与解释(共10小题 ,每小题4分 ,共40分)
1、Transcriptome转录组，所有RNA
2、Translesion replication（跨损伤DNA复制 跨损伤DNA复制（Translesion Synthesis)也被称为“跨缺刻复制”或备份复制（Backup synthesis)，是指当细胞处于较强烈而持久的SOS应答（SOS Response)生理条件下，一些受SOS机制控制的可诱导性DNA聚合酶得到表达，包括大肠杆菌细胞中的DNA聚合酶IV（DinB)和DNA聚合酶V（UmuC，活性形式是和2个分子的UmuD'形成的UmuD'2C)，以及真核生物细胞内的Rev32等被归类为Y族的DNA聚合酶（有别于专司DNA复制的复制型DNA聚合酶，如大肠杆菌DNA聚合酶III等），这些DNA聚合酶对DNA B型构象模板没有严格要求，有些甚至需要利用结合有RecA蛋白质分子的单链DNA作为模板，如大肠杆菌DNA聚合酶V。这些DNA聚合酶大多数都不具有“校对" 功能，也不严格依赖模板-引物-掺入核苷-DNA聚合酶共面，因此，有能力把插入到含有“损伤”（Lesion，泛指所有的损伤，区别于Damage)的核苷“掺入”到新生DNA链中，受上述两个方面的性质的决定，这样合成的DNA子链中的碱基可能是完全不符合沃森-克里克碱基配对要求，而DNA聚合酶自身又缺乏“校对活性”，于是所合成出的DNA通常含有“错误”，表现出"合成错误风险”（Error-Prone）。与此同时，由于类似的DNA复制的忠实性依然受"碱基选择”（Base selection)的制约，故也有可能最终不会出现复制错误，体现“Error-free"的特点。 研究发现，跨损伤DNA复制的忠实性既和所使用的DNA聚合酶有关，也和特定的“Lesion"类型有关。即使冒着引发基因突变的风险，也总比因DNA损伤造成基因组不能复制而死亡来的更具生命力。）
3、Riboswitch（核糖开关 核糖开关（riboswitches）指的是mRNA一些非编码区的序列折叠成一定的构象，这些构象的改变应答于体内的一些代谢分子，从而通过这些构象的改变达到调节mRNA转录的目的。）
4、Synonymous mutation（同义突变）
5、Tandem gene cluster（串联基因簇 基因组中串联重复数百次的某些基因或基因簇区域构成中度重复DNA区段，如RNA基因和组蛋白基因簇。）
6、Frameshift（移码突变）
7、Nucleosome positioning（核小体选位）
8、Non-autonomous transposon（不自主转座子）
9、Holliday junction（Holliday交叉 Holliday 交叉(Holliday Juncture/Junction)是以英国生物学家Robin Holliday的姓氏命名的一种发生在DNA分子之间的"交叉"(Crossing-Over)结构。1964年Robin Holliday推测，参与同源重组的DNA分子之间通过形成“交叉”作为"中间体"，并造成彼此之间的交换。后来这一推测得到证实，因此，同源重组DNA分子双方的交叉被定名为Holliday Juncture/Junction。Holliday交叉的形成是同源重组进行到第二个阶段的重要标志。整个过程是需要酶催化。在原核生物细胞中需要RecA和RuvAB等蛋白质的催化，而在真核生物细胞中则是RAD51等。RecA负责催化“链交换”，形成“交叉”，之后，可以利用其“分支迁移”催化活性稳固所建立的“交叉”，之后RuvAB的解旋酶活性可进一步促进“交叉”向纵深方向移动，形成更加稳固的“十字交叉”，RuvAB可"推动”Holliday交叉沿整个基因组分子移动（原核）。Holliday交叉又包括两种形式，一种是“十字交叉”，一种则是“T交叉”（Three-way Junction)。Holliday交叉必需得到精确的拆分，否则会妨碍DNA分子向子代细胞内的分配。人群中出现的染色体三体综合征就是因为在减数分裂同源重组过程中同源染色体之间形成的“交叉”没有被拆所致。这个过程被称为Non-disjunction。）
10、Polymerase switching（聚合酶的切换?????）
二、简答题(共5小题 ,每小题10分 ,共50分)
1、试从DNA和RNA结构的不同解释为什么DNA被广泛作为遗传信息的承载者?RNA在细胞内行使哪些功能?
2、什么是蛋白质组?什么是蛋白质组学?如何理解高等生物细胞中一个基因组可以产生多少个蛋白质组?
3、什么是解旋酶(helicase) ?请设计实验并画设计图证明一个DNA解旋酶是具有3’→5’还是5’→3’解旋活性 ?
4、论述原核生物基因表达调控的主要策略,并举例进行详细说明?
5、核糖体是蛋白质合成的主要机器 。请问原核生物有哪些亚基和分子组成?核糖体在蛋白质翻译过程中有哪些功能位点 ?起什么作用 ?
三、论述题(共4小题 ,每题15分 ,共60分)
1、在真核生物中 ,成熟的mRNA序列往往与基因组DNA序列之间存在许多差异,有些序列甚至在基因组DNA上根本没有相应的互补序列 。另外 ,同一种基因的DNA常常会转录出多种mRNA 。请解释并说明产生这些现象的机制及其意义 。
（转录出多条mRNA的情况多在原核生物中出现，真核生物一个基因编码一条多肽链，即转录一条mRNA。一，由于原核生物的基因组相对要小，多数基因按功能相关成串排列，是多顺反子的，而不像真核的是但顺反字，因此会同时携带不同蛋白的基因；二，多顺反子mRNA也有可能切割成多个单独的mRNA，避免了mRNA过长形成二级三级结构组织翻译进行。）
2、真核细胞mRNA的Ⅱ型RNA聚合酶转录 ,需要Ⅱ型启动子和转录因子TFⅡA ,TFⅡB ,TFⅡD ,TFⅡE 和TFⅡH等 。(1)请设计实验证明这些转录因子和RNA聚合酶Ⅱ结合到启动子的顺序;(2)请设计实验证明TFⅡD复合体可以单独准确结合到启动子TATA box上 ;(3)TFⅡD复合体包括哪些蛋白质?如果你有其中一个蛋白质的抗体 ,并知道其他几个蛋白质的大小 ,请设计实验验证TFⅡD复合体的组分 。
3、DNA复制具有很高的准确性(accuracy)或保真度(fidelity), 出错率低于1010分之一。请解释:(1)DNA复制过程中和复制后有哪些机制保证复制的准确性 ?
(2)为什么RNA聚合酶的保真度比DNA复制低 ?9
(DNA聚合酶有校对功能，而RNA聚合酶没有校对功能，所以发生错配的话DNA聚合酶可以自我修正，而RNA聚合酶则不可以。这样RNA聚合酶保真度就比DNA聚合酶低。)
(3)DNA复制的错误或突变对生物本身有何意义 ?
4、两位美国科学家Fire博士和Mello博士在分子生物学研究领域做出了重大贡献 ,并因此获得了2006年度的诺贝尔生理与医学奖。试论述其获奖成果中发现的重要分子生物学机制以及对分子生物学研究的重要影响 。
武 汉 大 学
2008年攻读硕士学位研究生入学考试试题
科目:分子生物学 科目代码:879
一、名词翻译与解释(共10小题 ,每小题4分 ,共40分)
1 Missence mutation（错义突变）
2 Polysome（多核糖体）
3 Non-Watson-Crick base pairing（非Watson-Crick碱基配对）
4 Tandem mass spectrometry（串联质谱法 串联质谱法是指用质谱作质量分离的质谱方法）
5 Shine-Dalgarno sequence（sd序列）
6 tmRNA（tmRNA 是存在于细菌的一类稳定的小RNA）
7 allostery activation（变构激活 体内有些酶，在最初合成和分泌时，没有催化活性，其结构必须因与某种物质发生结合而发生特定的改变，才能转变成有催化活性的酶。这个过程称为变构激活。）
8 Blue-white screening（蓝白斑筛选 野生型大肠杆菌产生的β-半乳糖苷酶可以将无色化合物X-gal(5-溴-4-氯-3-吲哚-β-D-半乳糖苷)切割成半乳糖和深蓝色的物质5-溴-4-靛蓝。有色物质可以使整个培养菌落产生颜色变化，而颜色变化是鉴定和筛选的最直观有效的方法。 ）
9 Attenuator（衰减子）
二、简答题(共5小题 ,每小题10分 ,共50分)
1、请描述两个经典实验证明遗传物质是DNA而不是蛋白质。
2、翻译过程中需要哪四种组分?它们的功能是什么?
3、在遗传物质复制、转录和翻译过程中如何确保其准确性?
（1）DNA复制的准确性：
1）DNA聚合酶依赖模板，保证遗传信息传代延续中子链与母链配对准确无误。
2）DNA聚合酶具有核酸外切酶活性，复制中出错时有即时校读功能，随时把错误配对的核苷酸切除，并利用其DNA聚合酶活性补回正确的核苷酸。
3）遵守严格的碱基互补配对规律。
（2）RNA转录的准确性：
1）RNA聚合酶以DNA双链中的有义链作为模板，严格按照碱基互补配对规律进行合成。
2）RNA聚合酶能够识别模板上的启动子和终止子。
（3）蛋白质合成的准确性：
1）在氨酰tRNA合成酶的作用下，形成氨基酰－tRNA，进入核糖体。氨酰tRNA合成酶具有绝对的专一性，既能特异识别AA，又能特异识别tRNA，使tRNA与其特异AA结合。如出差错，酶还可以“校正”。故它是保证翻译准确性的环节之一。
2）蛋白质的序列是由mRNA分子上的密码子排列决定的。通过tRNA上的反密码子识别mRNA上的密码子，一个一个地按顺序进行识别，从而合成多肽链。
4、真核细胞转录和加工中哪些过程是相偶联的?它们是如何偶联的?
5、酵母双杂交技术是利用其什么特点建立起来的?在科学研究中有什么作用?
三、论述题(共4小题 ,每题15分 ,共60分)
1、在真核生物转录中,有哪三种序列构成核心启动子?请说明Ⅱ型启动子中有哪些因子构成起始复合替,除了这些还有哪些是构成复合体所必须的?它们各有什么功能?
2、人的基因组大概有2.5~3万个基因,但它们构成的生物体蛋白质种类却有20多万种。人的基因组是怎样以有限的基因形成如此多的蛋白质的?
3、有一研究生想使他所感兴趣的一大肠杆菌的基因严格受碳源控制,在葡萄糖供应时,该基因不表达,当供应乳糖时,该基因大量表达?你如何帮助他实现这种想法?依据是什么?
4、miRNA在癌细胞中有的高水平表达,有的低水平表达。请解释什么是miRNA?并推测上面两种类型的miRNA各有什么生物学功能?有一种miRNA-21在癌细胞中高水平表达,请设计实验得到该miRNA的生物学功能。
武汉大学2009年攻读硕士学位研究生入学考试试题
分子生物学
一、名词翻译与解释
1.Regulatory gene(调节基因)
2.Real-time PCR
3.Nick translation （缺口平移 缺口翻译法或切口平移法是实验室最常用的一种脱氧核糖核酸探针标记法。利用E.coli DNA多聚酶I的多种酶促活性将标记的dNTP掺入到新合成的DNA链中从而形成高比活性的均匀标记的DNA探针。线状、超螺旋及带缺口的环状双链DNA均可作为缺口平移法的模板。）
4.Generic promoter（核心启动子）
5.Histone code （组蛋白密码，一种学说，由于组蛋白的氨基酸末端的多样化修饰扩充了遗传密码的信息库，如乙酰化、去乙酰化、甲基化等)
3.6.Proteomics（蛋白质组）
7.Gene targeting（基因靶向,又称为基因打靶）是一种利用同源重组方法改变生物体某一内源基因的遗传学技术。这一技术可以用于删除某一基因、去除外显子或导入点突变，从而可以对此基因的功能进行研究。基因打靶的效果可以是持续的，也可以是条件化的。例如，条件可以是生物体发育或整个生命过程中的一个特定时刻，或将效应限制在某一特定组织中。基因打靶的优点在于可以应用于任何基因，无需考虑其大小和转录活性。）
4.8.Single nucleotide polymorphism（snp）
9.Alternative mRNA processing（选择性剪接）
5.10.Replicon（复制子）
二、 简答题
1. 什么是DNA损伤？生物体DNA损伤与哪些因素有关？生物细胞有哪些机制来处理DNA损伤，并进行DNA损伤修复？
2. 表观（epigenetic）遗传修饰包括哪些内容？并举一例说明其在基因的表达调控和染色体重塑等方面有哪些重要作用？
3. 反式作用因子是直接或间接地识别或结合在各类顺式作用元件上参与调控靶基因转录效率的蛋白质，试问反式作用因子的DNA结合结构域有哪几种类型？特点如何？
4. PCR的原理是什么？在PCR反应中是否循环次数越多所合成的产物数量也越多？为什么？
5. 增强子和绝缘子在基因表达调控中的作用和特点有哪些？
三、 论述题
1. 论述转座子的类别、结构和转座机制及在基因表达与分子进化中的作用。
2. 在进行遗传重组和基因克隆与表达的研究中，对分子克隆的载体与宿主系统的选择有非常重要的作用。请论述各主要载体系统的特点及其宿主系统。
3. 从转录后水平上进行比较，论述原核生物和真核生物RNA加工的异同点。
4. 什么是HapMap（遗传图谱是某一物体的染色体图谱（也就是我们所指的连锁图谱）显示所知的基因或遗传标记的相对位置，而不是在每条染色体上特殊的物理位置。）计划、ENCODE计划（DNA元件百科全书计划）、Jim计划（吉姆工程是美国454生命科学公司（基因技术公司）在2005年前给“DNA之父”称誉的美国科学家詹姆斯•沃森绘制完整的个人基因组图谱的工作。）、Proteome计划（蛋白质组计划）？这些计划与人类基因组计划有何联系？这些计划对分子生物学的发展和生命活动的分子机制有什么影响和意义？
2011年3月2日星期三
一、科学名词解释及翻译
1.Chromatin remodeling（染色质重塑 DNA 复制、转录、修复、重组在染色质水平发生，这些过程中，染色质重塑可导致核小体位置和结构的变化，引起染色质变化。ATP 依赖的染色质重塑因子可重新定位核小体，改变核小体结构，共价修饰组蛋白。重塑包括多种变化，一般指染色质特定区域对核酶稳定性的变化。人们发现体内染色质结构重塑存在于基因启动子中，转录因子TF 以及染色质重塑因子与启动子上特定位点结合，引起特定核小体位置的改变（滑动），或核小体三维结构的改变，或二者兼有，它们都能改变染色质对核酶的敏感性。关于重塑因子调节基因表达机制的假设有两种： 机制1） 1 个转录因子独立地与核小体DNA 结合（DNA 可以是核小体或核小体之间的），然后，这个转录因子再结合1 个重塑因子，导致附近核小体结构发生稳定性的变化，又导致其他转录因子的结合，这是一个串联反应的过程； 机制2） 由重塑因子首先独立地与核小体结合，不改变其结构，但使其松动并发生滑动，这将导致转录因子的结合，从而使新形成的无核小体的区域稳定。）
2.Internal ribosome entry site （内部核糖体进入位点 内部核糖体进入位点，缩写IRES，是一段核酸序列，它的存在能够使蛋白质翻译起始不依赖于5‘帽结构，从而使直接从信使RNA（mRNA）中间起始翻译成为可能。通常来讲，真核生物翻译只能从mRNA的5‘端开始，因为翻译起始必须依赖于5’端的帽子结构。一般来讲，内部核糖体进入位点通常位于RNA病毒基因组的5’非翻译区（UTR），这样病毒蛋白的翻译就可以不依赖于5‘帽子结构。）
3.Alternative splicing(选择性剪接)
4.Non-autonomous transposon（非自主转座子）
5.Shine-Dalgarno equence
6.Realtime PCR
7.Ribozyme（核酶）
8.SOS response（sos应答）
9.Telomerase（端粒酶）
10.Suppressor mutation（抑制因子突变）
二、简答题
1.简述色氨酸操纵子的调控机制。
2.DNA在复制过程中如何保持准确性？
3.分别阐述克隆载体和表达载体（各5种）及其特点和用途。
4.什么是RNA editing？它的机制是什么？
5.什么是染色体步移？它的作用是什么？
三、论述题
1.真核生物转录调控因子的类型和特点？阐述根据一种转录调控因子的特点建立的分子生物学技术的及其应用。
2.真核生物和原核生物的基因组的特点及差异？已知某基因的cDNA（长14Kb），如何用实验证明该生物基因还有内含子？如何确定内含子在全长中的比例？如何用实验确定某未知基因的功能？
3.每种基因a是诱导表达基因，在分子B（小分子化合物）的作用下可以诱导表达。已知该基因的序列，该基因上启动子的序列。已知某调控元件的序列为ACGTCG，基因c表达的蛋白C可以结合在该调控元件上，试用三种证明该调控元件可以诱导基因a表达。
武汉大学
2013年攻读硕士研究生入学考试微生物试题
一、名词解释（共10小题，每题4分，共40分）
1. Ribozyme
2. Missense Mutation
3. Insulator(绝缘子)
4. RNA trans-splicing（RNA反式剪接 指的是两条不同的pre-mRNA的外显子连接到一起。与正常的顺式剪接不同，这里的两段外显子是来自不同的pre-mRNA的，但却可能来自同一基因。“经典”反式剪接见于锥虫和线虫，近期在人类身上也发现了反式剪接。）
5. Nucleotide excision repair(核苷酸切除修复)
6. Transposon（转座子）
7. Dam methylase（dam甲基化酶 Dam 甲基化酶可在 GATC 序列中的腺嘌呤 N6 位置上引入甲基。一些限制酶（PvuⅡ, BamHⅠ、BclⅠ、BglⅡ、XhoⅡ、MboⅠ、 Sau3AⅠ）的识别位点中含 GATC 序列，另一些酶 ClaⅠ（1/4）、 XbaⅠ（1/16）、TaqⅠ（1/16）、MboⅠ（1/16）、 HphⅠ（1/16） 的部分识别序列含此序列，如平均 4 个 ClaⅠ 位点（ATCGATN）中就有一个该序列。
有些限制酶对 Dam 甲基化的 DNA 敏感，不能切割相应的序列，如 BclⅠ、 ClaⅠ、 XbaⅠ 等。对甲基化不敏感的有 BamHⅠ、 Sau3AⅠ、 BglⅡ、 PvuⅠ 等。 MboⅠ 和 Sau3AⅠ 识别和切割位点相同，但其差异就在于前者对甲基化敏感。
一般哺乳动物 DNA 不会在腺嘌呤 N6 上甲基化，因此对甲基化敏感的限制酶切割这些 DNA 不会受到影响。当需要在这些敏感位点上完全切割 DNA 时，可利用 dam- E.coli 扩增并提取 DNA 。）
8. Spliceosome（剪接体）
9. Core promotor
10. SNP
二、简答题（共5小题，每题10分，共50分）
1. 真核生物mRNA的5’帽子结构有何生物学功能？其缺失会造成什么后果？
2. 某一基因开放阅读框中的一个碱基突变会对该基因编码产物产生什么影响？
3. 请简述真核生物的mRNA和原核生物的mRNA有何不同。
4. 请简述Ⅰ型内含子剪切的过程.
5. 请简述Western blot 的原理和步骤。
三、论述题（共3小题，每题20分，共60分）
1. 研究基因功能通常是降低或升高基因表达水平，请简要说出三种相关研究方法及原理。
2. mRNA和蛋白质的降解是一个有序的过程，其中microRNA和泛素起了非常重要的作用，请简述microRNA的概念、产生过程、作用机制，或者泛素的概念和蛋白质泛素化的过程。
3. 某实验需将1kb的cDNA片段插入某氨苄青霉素抗性的表达载体，在片段两边各有一个EcoRI位点，靠近5’端300bp的地方有一EcoRV位点，载体多克隆位点从5’依次为BamHI、HindIIII、EcoRI、EcoRV、XhoI位点，实验设计步骤如下：
（1）用EcoRI处理载体，然后用碱性磷酸酶处理。
（2）用EcoRI处理片段，然后与步骤（1）中的载体混合，加入DNA连接酶，在适当的条件下使cDNA片段与载体连接。
（3）连接产物转化到大肠杆菌，并在含有氨苄青霉素的LB平板上生长，除此之外，还设了以下对照：
对照1：在含有抗生素的平板上涂布未被转化的大肠杆菌感受态细胞。
对照2：用未被酶切处理的载体转化大肠杆菌感受态细胞，并在含有抗生素的平板上生长。
对照3：用EcoRI处理的载体，不用碱性磷酸酶处理，不加cDNA片段，然后加连接酶做连接反应，并转化大肠杆菌感受态细胞，并在含有抗生素的平板上生长。
对照4：除了用碱性磷酸酶处理外，其他同对照3.
某学生做了三次试验，结果如表：
克隆数
实验1 实验2 实验3
对照1 太多，无法计算 0 0
对照2 太多，无法计算 0 大于1000
对照3 太多，无法计算 0 350
对照4 太多，无法计算 0 25
实验组 太多，无法计算 0 34
请回答下列问题：
问题1：四个对照组各有什么用？
问题2：为什么要用碱性磷酸酶处理？
问题3：哪次实验数据比较合理？为什么？其他次实验失败的原因是什么？
问题4：设计实验鉴定克隆是否正确？
2010年 一．名词解释
1.表观遗传（epigenetics）是指DNA序列不发生变化，但基因表达却发生了可遗传的改变。这种改变是细胞内除了遗传信息以外的其他可遗传物质发生的改变，且这种改变在发育和细胞增殖过程中能稳定传递。 表观遗传改变从以下3个层面上调控基因的表达，DNA
修饰：DNA共价结合一个修饰基团，使具有相同序列的等位基因处于不同的修饰状态；
蛋白修饰：通过对特殊蛋白修饰或改变蛋白的构象实现对基因表达的调控；非编码RNA
的调控：RNA可通过某些机制实现对基因转录的调控以及对基因转录后的调控，如RNA干扰(RNA interference,RNAi)。表观遗传学研究包括染色质重塑、DNA甲基化、X染色体失活，非编码RNA调控4个方面，任何一方面的异常都将影响染色质结构和基因表达，导致复杂综合征、多因素疾病以及癌症。 2. 肽指纹图谱(Peptide Mass Fingerprinting, PMF) 测定对蛋白酶解或降解后所得多肽混合物进行质谱分析的方法。质谱分析所得肽断与多肽蛋白数据库中蛋白质的理论肽断进行比较，判断出所测蛋白是已知还是未知。由于不同的蛋白质具有不同的氨基酸序列，不同蛋白质所得肽断具有指纹特征。采用肽指纹谱的方法已对酵母、大肠杆菌、人心肌等多种蛋白质组进行了研究。
3. RNA剪接RNA splicing 除去初级转录产物中的内含子，并将外显子连接起来，形成成熟的RNA分子的过程。
4. 管家基因house-keeping gene 生物体各类细胞中都表达，对维持细胞存活和生长所必需的蛋白质编码的基因。
5. frameshift mutation 在基因编码区，核苷酸插入或缺失导致三联体密码子阅读方式的改变，从而使该基因的相应编码序列发生改变。
6. DNA binding domainDNA结合域
7.Shine-dalgarno sequence SD序列 SD序列是原核生物mRNA中5＇端富含嘌呤的短核苷酸序列,一般位于mRNA的起始密码AUG的上游3至11个核苷酸处,并且同16S rRNA 3＇端的序列互补。
8. gel retardation凝胶阻滞 该方法用来研究DNA与特异性蛋白的相互作用，通常是放射性标记的DNA片段与纯化蛋白，或提取物中的蛋白混合物相结合，然后在非变性凝胶中分析该产物。与游离DNA相比，蛋白-DNA复合物的迁移率将降低，因此，与游离DNA相对应，人们将观察到带中的“阻滞”。
9. 染色质免疫沉淀法（Chromatin immunoprecitation，ChIP） 是研究体内DNA与蛋白质相互作用的重要工具。它可以灵敏地检测目标蛋白与特异DNA片段的结合情况，还可以用来研究组蛋白与基因表达的关系。它的基本原理是在活细胞状态下固定蛋白质－DNA复合物，并将其随机切断为一定长度范围内的染色质小片段，然后通过免疫学方法沉淀此复合体，特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段，通过对目的片断的纯化与检测，从而获得蛋白质与DNA相互作用的信息。它能真实、完整地反映结合在DNA序列上的调控蛋白，是目前确定与特定蛋白结合的基因组区域或确定与特定基因组区域结合的蛋白质的一种很好的方法。
10. rho-dependent transcription termination
08名解
1.表观遗传（epigenetics）是指DNA序列不发生变化，但基因表达却发生了可遗传的改变。这种改变是细胞内除了遗传信息以外的其他可遗传物质发生的改变，且这种改变在发育和细胞增殖过程中能稳定传递。
表观遗传改变从以下3个层面上调控基因的表达，DNA修饰：DNA共价结合一个修饰基团，使具有相同序列的等位基因处于不同的修饰状态；蛋白修饰：通过对特殊蛋白修饰或改变蛋白的构象实现对基因表达的调控；非编码RNA的调控：RNA可通过某些机制实现对基因转录的调控以及对基因转录后的调控，如RNA干扰(RNA interference,RNAi)。表观遗传学研究包括染色质重塑、DNA甲基化、X染色体失活，非编码RNA调控4个方面，任何一方面的异常都将影响染色质结构和基因表达，导致复杂综合征、多因素疾病以及癌症。 2. 肽指纹图谱(Peptide Mass Fingerprinting, PMF)
测定对蛋白酶解或降解后所得多肽混合物进行质谱分析的方法。质谱分析所得肽断与多肽蛋白数据库中蛋白质的理论肽断进行比较，判断出所测蛋白是已知还是未知。由于不同的蛋白质具有不同的氨基酸序列，不同蛋白质所得肽断具有指纹特征。采用肽指纹谱的方法已对酵母、大肠杆菌、人心肌等多种蛋白质组进行了研究。 3. RNA剪接RNA splicing
除去初级转录产物中的内含子，并将外显子连接起来，形成成熟的RNA分子的过程。 4. 管家基因house-keeping gene
生物体各类细胞中都表达，对维持细胞存活和生长所必需的蛋白质编码的基因。 5. frameshift mutation 在基因编码区，核苷酸插入或缺失导致三联体密码子阅读方式的改变，从而使该基因的相应编码序列发生改变。
6. DNA binding domainDNA结合域
7.Shine-dalgarno sequence SD序列
SD序列是原核生物mRNA中5＇端富含嘌呤的短核苷酸序列,一般位于mRNA的起始密码AUG的上游3至11个核苷酸处,并且同16S rRNA 3＇端的序列互补。 8. gel retardation凝胶阻滞
该方法用来研究DNA与特异性蛋白的相互作用，通常是放射性标记的DNA片段与纯化蛋白，或提取物中的蛋白混合物相结合，然后在非变性凝胶中分析该产物。与游离DNA相比，蛋白-DNA复合物的迁移率将降低，因此，与游离DNA相对应，人们将观察到带中的“阻滞”。
9. 染色质免疫沉淀法（Chromatin immunoprecitation，ChIP） 是研究体内DNA与蛋白质相互作用的重要工具。它可以灵敏地检测目标蛋白与特异DNA片段的结合情况，还可以用来研究组蛋白与基因表达的关系。它的基本原理是在活细胞状态下固定蛋白质－DNA复合物，并将其随机切断为一定长度范围内的染色质小片段，然后通过免疫学方法沉淀此复合体，特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段，通过对目的片断的纯化与检测，从而获得蛋白质与DNA相互作用的信息。它能真实、完整地反映结合在DNA序列上的调控蛋白，是目前确定与特定蛋白结合的基因组区域或确定与特定基因组区域结合的蛋白质的一种很好的方法。
10. rho-dependent transcription termination
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2009年
一． 名词解释
1. 调节基因regulatory gene
控制编码RNA基因或蛋白质基因表达的基因。如编码激活蛋白或阻遏蛋白的基因。 也就是，一段有效的DNA片段，它可转录翻译而产生调节蛋白，该蛋白质与操纵基因相互作用，而对操纵子的活动进行控制。 2. real time PCR实时PCR
一种新的核酸微量分析技术，是引入荧光标记分子，在PCR反应中产生的荧光信号，与PCR产物量成正比，对每一反应时刻的荧光信号进行分析，计算出PCR的产物量。 3. 切口平移nick translation
制备标记DNA的一种方法。先用DNA酶使DNA双链上形成不对称的切口，再利用DNA聚合酶Ⅰ的5′→3′外切酶活性将切口处的5′-P-核苷酸逐个切除，同时其DNA聚合酶活性又不断将新的含标记的核苷酸按碱基配对原则加入形成新链，这样就使缺口不断向3′端移动，同时标记了DNA。 4. 通用启动子generic promoter
（核心启动子）RNA聚合酶正常起始转录所必需的最小DNA序列。RNA聚合酶Ⅱ识别的启动子通常包含转录起始位点及其上游或下游约35个核苷酸的序列，大小约为40个核苷酸。含有TATA框，起始子(Inr)，TFⅡB识别元件(BRE)和核心启动子下游元件(DPE)等序列模块。
5.组蛋白密码 Histone code
所谓组蛋白密码就是对结合DNA的组蛋白进行一系列修饰，从而影响某些基因何时以及以何种方式被打开或关闭。
6. 蛋白质组学proteomics
阐明生物体各种生物基因组在细胞中表达的全部蛋白质的表达模式及功能模式的学科。包括鉴定蛋白质的表达、存在方式(修饰形式)、结构、功能和相互作用等。 7. 基因打靶gene targeting
通过DNA分子同源重组，特异性改变基因组中靶基因序列，以研究目标基因的体内功能或相关疾病发病机制的一种基因操作技术。
8. 单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism，SNP)
不同物种、个体基因组DNA序列同一位置上的单个核苷酸存在差别的现象。有这种差别的基因座、DNA序列等可作为基因组作图的标志。人基因组上平均约每1000个核苷酸即可能出现1个单核苷酸多态性的变化，其中有些单核苷酸多态性可能与疾病有关，但可能大多数与疾病无关。单核苷酸多态性是研究人类家族和动植物品系遗传变异的重要依据。
9. alternative mRNA processing
alternative splicing选择性剪接（也叫可变剪接）是指从一个mRNA前体中通过不同的剪接方式（选择不同的剪接位点组合）产生不同的mRNA剪接异构体的过程，而最终的蛋白产物会表现出不同或者是相互拮抗的功能和结构特性，或者，在相同的细胞中由于表达水平的不同而导致不同的表型。 10. 复制子replicon
作为含有一个复制起始点的独立复制单元的一个完整DNA分子或DNA分子上的某段区域。质粒、细菌染色体和噬菌体等通常只有一个复制起始点，因而其DNA分子就构成一个复制子；真核生物染色体有多个复制起始点，因而含有多个复制子。
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